Kematian False Dmitry tidak menghentikan Masalah. Perang saudara berlanjut, meliputi tanah baru, penipu baru muncul. Pada bulan pertama masa pemerintahannya, Vasily Shuisky harus menekan beberapa upaya pertunjukan oleh kelas bawah kota Moskow. Di Moskow, mereka takut raja Polandia Sigismund akan memulai perang untuk menggulingkan penipu dan memukuli Polandia. Oleh karena itu, dari beberapa ribu tamu Polandia dan tentara bayaran False Dmitry yang selamat dari pemberontakan Mei di Moskow, hanya rakyat jelata yang dibebaskan, dan orang-orang bangsawan dibiarkan sebagai sandera, diberi perawatan yang baik dan didistribusikan di bawah pengawasan di berbagai kota. Shuisky melanggar etiket diplomatik dan bahkan menahan kedutaan Polandia Gonsevsky di Moskow.
Namun, ketakutan ini sia-sia. Polandia sendiri mengalami kesulitan. Polandia memulai perang dengan Swedia dan merebut kembali kota Pernov (Pärnu) darinya di Livonia. Selain itu, Zaporozhye Cossack, yang dipimpin oleh Hetman Sagaidachny, melakukan sejumlah serangan yang berhasil dan menjarah Kafa dan Varna. Hal ini membuat marah Ottoman dan mereka menyatakan perang terhadap Persemakmuran. Benar, pasukan utama tentara Turki dikaitkan dengan perang dengan Persia dan pasukan tambahan dikirim melawan Polandia, dan Polandia memukul mundur serangan itu. Di Polandia sendiri, beberapa raja yang tidak puas dengan kebijakan raja menimbulkan kehebohan. Negara itu dilanda perang saudara. Karena itu, Polandia tidak punya waktu untuk Moskow.
Dengan demikian, Moskow mengabaikan ancaman yang lebih serius - ancaman internal. Lagi pula, masalah yang menyebabkan Masalah tidak terselesaikan. Dan ancaman eksternal memainkan peran penting, tetapi bukan peran utama. Provinsi itu marah: Boyar Duma memilih tsar tanpa dukungan yang diperlukan dari semua negeri. Ternyata para bangsawan membunuh "tsar yang baik" dan merebut kekuasaan, menyerahkan tahta kepada "tsar boyar". Provinsi itu bergolak: istilah pencarian buronan ditingkatkan menjadi 15 tahun; para prajurit mengingat penghargaan dermawan dari False Dmitry; penduduk selatan takut akan pembalasan dan teror (seperti di bawah Godunov) karena membantu penipu; khawatir tentang Cossack, yang secara aktif mendukung pembohong; Shuisky menyingkirkan pendukung Dmitry Palsu, mengusir mereka dari ibu kota, banyak yang dikirim ke perbatasan selatan.
Pada musim panas 1606, pemberontakan spontan melanda seluruh selatan negara itu, yang diganggu oleh desas-desus tentang "keselamatan Tsar Dmitry yang baik." Pusat perjuangan melawan raja baru di Tanah Utara adalah "ibu kota" penipu pertama - Putivl. Di sini penduduk kota pemberontak, para petani, memilih Ivan Bolotnikov, yang datang kepada mereka dengan detasemen, sebagai "komandan besar". Ivan Bolotnikov, menurut versi yang paling luas, adalah budak Pangeran Telyatevsky. Di masa mudanya, ia melarikan diri dari tuannya ke padang rumput ke Cossack, di sini ia ditangkap oleh Tatar dan dijual sebagai budak ke Turki. Dia menghabiskan beberapa tahun dalam perbudakan, di dapur kapal sebagai pendayung. Setelah pertempuran laut yang gagal dengan kapal-kapal Kristen untuk Turki, ia dibebaskan dan menuju ke Venesia, di mana ia tinggal di kompleks perdagangan Jerman. Dari sini, setelah mendengar cerita tentang awal Masalah di negara Rusia, Bolotnikov pindah melalui Jerman dan Polandia ke Rusia. Desas-desus tentang "penyelamatan ajaib" Tsar Dmitry Moskow menarik Ivan ke Sambor, di mana buronan Moskow Mikhail Molchanov, mantan sekutu False Dmitry I. Molchanov, bersembunyi bersama istrinya Yuri Mnishek Yadviga, dan menampilkan dirinya sebagai raja. Petualang ini memperkenalkan dirinya kepada Bolotnikov sebagai seorang tsar yang melarikan diri setelah kudeta Mei di Moskow. Penipu baru berbicara dengan Bolotnikov untuk waktu yang lama, dan kemudian memberinya surat kepada Pangeran Grigory Shakhovsky dan mengirimnya ke Putivl sebagai utusan pribadinya dan "voivode besar".
Padahal, perang saudara sudah memasuki fase aktif. Tentara Bolotnikov termasuk perkebunan utama dan kelompok sosial negara Rusia: petani dan budak, Seversk, Terek, Volga dan Zaporozhye Cossack, perwakilan kaum bangsawan. Selain itu, pemberontakan didukung oleh perwakilan aristokrasi, di antaranya Pangeran Grigory Shakhovsky dan voivode Chernigov Andrei Telyatevsky, mantan pemilik Bolotnikov.
Pada musim panas 1606, 30 ribu. Tentara Bolotnikov pindah ke Moskow. Benteng-benteng Kromy dan Yelets direbut, gudang senjata kaya yang mengisi kembali cadangan para pemberontak. Pasukan pemerintah di bawah komando gubernur pangeran Vorotynsky dan Trubetskoy dikalahkan di Kromy dan Yelets. Banyak tentara dari pasukan Tsar pergi ke sisi pemberontak. Mengambil keuntungan dari kesalahan gubernur Tsar, para pemberontak dengan cepat maju ke Moskow. Semakin banyak detasemen petani pemberontak dituangkan ke dalam pasukan Bolotnikov. Selain itu, dalam perjalanan ke Moskow, detasemen besar bangsawan layanan bergabung dengan Bolotnikov, yang menentang boyar tsar Shuisky. Gubernur senior Ryazan Prokopy Lyapunov dan yang lebih muda - Grigory Sumbulov, memimpin milisi Ryazan, perwira tinggi Istoma Pashkov - sebuah detasemen besar orang-orang yang bertugas. Tula, Kashira, Kaluga, Mozhaisk, Vyazma, Vladimir dan Astrakhan memberontak. Di Volga, Mordovia dan Mari (Cheremis) memberontak, mereka mengepung Nizhny Novgorod.
Pemberontak dalam perjalanan ke Moskow mendekati Kolomna. Pada Oktober 1606, Posad Kolomna direbut dengan serangan, tetapi Kremlin terus melawan. Meninggalkan sebagian kecil pasukannya di Kolomna, Bolotnikov berjalan di sepanjang jalan Kolomna ke Moskow. Di desa Troitskoye, distrik Kolomensky, ia berhasil mengalahkan pasukan pemerintah. Pada 22 Oktober, pasukan Bolotnikov ditempatkan di desa Kolomenskoye dekat Moskow. Di sini ia membangun penjara (benteng), dan mulai mengirim surat ke Moskow dan berbagai kota, menyerukan untuk mendukung kedaulatan yang sah Dmitry Ivanovich dan membangkitkan yang kurang beruntung dan yang miskin melawan yang kaya. “Kalian semua, budak boyar, pukuli bangsawan kalian, ambil istri mereka dan semua properti mereka, perkebunan dan perkebunan! Anda akan menjadi orang-orang mulia, dan Anda, yang disebut mata-mata dan tanpa nama, membunuh tamu dan pedagang, membagi perut mereka di antara Anda! Anda adalah yang terakhir - sekarang Anda akan menerima bangsawan, kelicikan, voivodeship! Cium semua salib untuk penguasa yang sah Dmitry Ivanovich! Oleh karena itu, jalan pasukan Bolotnikov disertai dengan pogrom yang mengerikan, orang-orang menanggapi teror dengan teror, bertempur seolah-olah ada orang asing di sekitar (pasukan tsar di wilayah yang dilanda pemberontakan bertindak dengan cara yang sama).
Milisi Bolotnikov terus tumbuh, detasemen terpisah, terutama dari budak, yang, dengan serangan dan perampokan mereka, menjaga ibu kota dalam keadaan terkepung, menonjol darinya. Pada bulan November, Cossack dari Ileika Muromets bergabung dengan Bolotnikov. Dia adalah penipu lain, menyamar sebagai Tsarevich Peter Fyodorovich, yang pada kenyataannya tidak pernah ada putra Tsar Fyodor I Ivanovich. Orang-orang Moskow sudah siap untuk mematuhi Bolotnikov, hanya meminta untuk menunjukkan kepada mereka Tsarevich Dmitry, dan bahkan memulai negosiasi dengannya. Bolotnikov yang senang mengirim utusan ke Putivl. Seperti, biarkan "tsar" datang lebih cepat, kemenangan sudah dekat. Tapi Dmitry tidak pernah muncul. Banyak yang mulai mengungkapkan keraguan tentang keberadaan Dmitry dan pergi ke sisi Shuisky.
Sementara itu, Shuisky tidak duduk diam dan secara aktif mempersiapkan serangan balik. Pinggiran kota dan pemukiman Moskow dibentengi. Pasukan gubernur Skopin-Shuisky, Golitsyn dan Tatev menetap di gerbang Serpukhov, dari mana mereka mengawasi kamp musuh. Komunikasi terjalin antara Moskow dan kota-kota sekitarnya, pasukan menjaga jalan. Pada bulan November, bala bantuan tiba dari Tver dan Smolensk, yang sebagian besar terdiri dari bangsawan dan warga kota. Pada saat yang sama, Shuisky secara aktif menawar dengan bagian mulia dari kamp pemberontak. Keluarga Lyapunov dan Pashkov membenci Shuisky, tetapi mereka takut akan kerusuhan "rakyat".
Pasukan Bolotnikov tumbuh menjadi 100 ribu orang (pasukannya beroperasi di wilayah yang luas), tetapi kualitas pertempurannya turun. Di antara para pemberontak, ada banyak budak, gelandangan, petani yang tidak memiliki pengalaman tempur, bersenjata dan terorganisir dengan buruk. Cossack dan bangsawan - dua inti pertempuran tentara, mereka dihina. Namun, mereka juga saling menentang. Akibatnya, perpecahan terjadi di pasukan Bolotnikov: satu kamp terdiri dari bangsawan dan anak-anak boyar, yang lain - budak, Cossack, dan orang lain. Yang terakhir memiliki Ivan Bolotnikov sebagai pemimpin mereka, yang pertama - Istoma Pashkov dan saudara-saudara Lyapunov. Ketidaksepakatan muncul di antara para pemimpin, sebagai akibatnya, pertama Lyapunov, dan kemudian Istoma Pashkov, pergi ke sisi Shuisky. Shuisky, sementara itu, memperkuat Moskow secara menyeluruh, membentuk pasukan baru dari milisi kota-kota lain. Selain itu, Shuisky memikat banyak bangsawan dari kamp Bolotnikov, menjanjikan mereka hadiah dan pangkat.
Melihat situasi semakin buruk dan pasukan Shuisky semakin bertambah, Bolotnikov memutuskan untuk menyerang. Pada 26 November, ia mencoba mengambil alih biara Simonov, tetapi dikalahkan oleh pasukan Tsar di bawah komando seorang komandan muda dan berbakat, keponakan Tsar Mikhail Skopin-Shuisky. Pada saat pertempuran yang menentukan, sebuah detasemen bangsawan besar Pashkov meninggalkan kamp pemberontak, ini memutuskan hasil pertempuran yang mendukung tentara tsar. Pasukan Bolotnikov bercokol di kamp Kolomna. Skopin-Shuisky mengepung Bolotnikovites dan mulai menembaki. Tsar Vasily mencoba mencapai kesepakatan dengan Bolotnikov sendiri, menjanjikan pangkat tinggi, tetapi pemimpin pemberontak menolak untuk berdamai. Setelah tiga hari tembakan artileri, pasukan beraneka ragam Bolotnikov tidak tahan dan melarikan diri. Bagian dari Cossack menguasai desa Zaborie, di mana pada 2 Desember para pemberontak dikalahkan lagi. Cossack Ataman Bezzubtsev pergi ke sisi Skopin-Shuisky. Tsar Vasily memaafkan mereka. Sisa tahanan yang diambil dalam pertempuran atau selama penerbangan digantung atau dilumpuhkan dengan tongkat, ditenggelamkan. Bolotnikov melarikan diri ke Serpukhov, dan kemudian Kaluga, Ileika Muromets pergi ke Tula.
Dengan demikian, para pemberontak tidak pernah bisa merebut ibu kota. Dalam pertempuran yang menentukan, Bolotnikovites dikalahkan oleh voivod tsar, yang difasilitasi oleh pengkhianatan detasemen bangsawan yang pergi ke sisi Tsar Vasily Shuisky.
Di Kaluga, Bolotnikov mengumpulkan sekitar 10 ribu orang. Itu dikepung oleh pasukan Tsar. Namun, komandan utama adalah saudara tsar Ivan Shuisky yang tidak berbakat. Akibatnya, pengepungan Kaluga berlanjut dari Desember 1606 hingga Mei 1607. Para pemberontak membela diri dengan terampil dan putus asa, menolak serangan, melakukan serangan mendadak yang berani, menyebabkan kerusakan besar pada pasukan Tsar. Para gubernur Tsar memutuskan untuk membakar benteng kayu dan, setelah memobilisasi para petani di sekitarnya, mulai memasok kayu bakar yang mereka gunakan untuk melapisi dinding. Namun, para pemberontak menebak rencana ini dan meledakkan "sapuan", membunuh dan melukai sejumlah besar prajurit Tsar. Pada saat ini, pemberontak lain mencoba untuk membuka blokir Kaluga, tetapi dikalahkan. Jadi, detasemen Mezetsky, yang dikirim dari Putivl oleh Shakhovsky untuk menyelamatkan Bolotnikov, dikalahkan oleh pasukan Ivan Romanov di sungai. Vyrke.
Kemudian, pasukan Telyatevsky dan Pseudo-Peter mencoba menerobos ke Bolotnikov. Pada 1 Mei 1607, Don dan Cossack Ukraina mengalahkan pasukan Tsar di Sungai Pchelna. Mengambil keuntungan dari kebingungan di antara pasukan pengepungan, Bolotnikov melakukan serangan mendadak dan mengalahkan gubernur Tsar, yang mundur, meninggalkan artileri dan kereta bagasi. Bagian dari pasukan Tsar pergi ke sisi pemberontak. Hanya resimen Skopin-Shuisky yang mundur dengan sempurna. Setelah itu Bolotnikov pindah ke Tula, di mana ada benteng batu yang lebih kuat, dan bersatu dengan detasemen pemberontak lainnya.
Kemudian Bolotnikov memulai kampanye ke-2 melawan Moskow. Namun, Tsar Vasily tidak tinggal diam. Mobilisasi orang-orang "penghormatan" ("penghormatan" - prajurit yang dipanggil dari warga kota dan komunitas petani) di seluruh negeri diumumkan, dan secara pribadi memimpin pasukan besar yang sedang dibentuk di Serpukhov. Pusat-pusat pemberontakan berangsur-angsur hancur. Para perusuh diusir dari Nizhny Novgorod. A. Golitsyn mengalahkan Telyatevsky di dekat Kashira. Munculnya beberapa Peter yang tidak dikenal alih-alih "tsar baik" yang diharapkan Dmitry, yang melepaskan teror terhadap lawan, mendinginkan banyak orang, kota-kota pemberontak menjadi tenang, membawa pengakuan. Pada bulan Mei, tentara Tsar bergerak ke arah pemberontak. Tsar sendiri mengambil bagian dalam kampanye, dan resimen individu dipimpin oleh Mikhail Skopin-Shuisky, Pyotr Urusov, Ivan Shuisky, Mikhail Turenin, Andrei Golitsyn, Prokopy Lyapunov dan Fyodor Bulgakov.
Bolotnikovites mencoba untuk melewati pasukan utama tentara tsar dan pergi ke Moskow, tetapi melewati Kashira, para pemberontak bertemu dengan sayap tentara tsar di Sungai Vosma. Pada tanggal 5-7 Juni 1607, terjadi pertempuran. Bolotnikovites memiliki keunggulan dalam kekuatan - 30-38 ribu tentara. Namun, gubernur Tula mengkhianati Bolotnikov dan dengan 4 ribu. detasemen pergi ke sisi pasukan Tsar. Dan detasemen Ryazan Lyapunov masuk ke bagian belakang pasukan Bolotnikov. Hal ini menyebabkan kepanikan di antara orang-orang Bolotnikov dan mereka mundur. Bagian dari pasukan Bolotnikov dipotong dan ditangkap, para tahanan dieksekusi. Setelah Pertempuran Vosemsk, pasukan Bolotnikov didorong kembali ke Tula.
Tsar Vasily Shuisky mengirim beberapa resimen yang dipimpin oleh Mikhail Skopin-Shuisky ke Bolotnikov. Di pinggiran Tula, Bolotnikov memutuskan untuk bertarung di Sungai Voronya, para pemberontak menutup diri dengan serif dan untuk waktu yang lama memukul mundur serangan kavaleri tsar. Kedua belah pihak menderita banyak korban. Namun, para pemanah melakukan manuver memutar, Bolotnikovites goyah dan berlari, banyak yang terbunuh selama pengejaran. Bolotnikov kehilangan setengah dari pasukannya dalam pertempuran ini - sekitar 20 ribu orang. Dengan sisanya, dia mengunci diri di Tula. Dengan demikian, Bolotnikov menderita kekalahan yang menentukan dan kehilangan inisiatif strategis.
Pada 30 Juni, Tsar Vasily sendiri dengan pasukan utama mendekati Tula. Orang-orang sezaman melaporkan bahwa tentara Tsar berjumlah 100-150 ribu orang. Bolotnikov dan "Tsarevich Peter" tidak memiliki lebih dari 20 ribu orang yang tersisa. Senjata pengepungan mulai menembaki kota dari kedua tepi sungai. Namun, Tula memiliki benteng yang kuat, dan Bolotnikov ditinggalkan dengan inti pemberontak yang paling efisien. Karena itu, yang terkepung bertahan hingga Oktober 1607. Pada tahap awal pengepungan, para pembela kota melakukan serangan mendadak dan bertahan dengan berani. Semua upaya gubernur tsar untuk menguasai kota itu ternyata tidak berhasil.
Kemudian pasukan tsar, atas ide Murom putra boyar Ivan Krovkov, memutuskan untuk memblokir Sungai Upu di bawah kota dengan bendungan agar Tula dibanjiri. Di sebelah kanan, tepi rawa, sebuah bendungan berukuran sekitar setengah mil didirikan, yang seharusnya mencegah sungai meluap ke dataran rendah selama banjir musim gugur, tetapi menyebabkan kenaikan permukaan air yang tajam. Memang, banjir musim gugur benar-benar memutus kota dari dunia luar, mengubahnya menjadi pulau berawa di tengah dataran yang benar-benar banjir. Banyak amunisi rusak, serta persediaan biji-bijian dan garam disimpan di ruang bawah tanah. Segera, kelaparan dan epidemi yang mengerikan dimulai di Tula, yang memperburuk kontradiksi internal di antara para pemberontak. Pemberontak mencoba meledakkan bendungan, tetapi Kravkov yang sama memperingatkan Shuisky, dan upaya itu gagal.
Bolotnikov mengirim utusan ke Mikhail Molchanov dan Grigory Shakhovsky lebih dari sekali selama pengepungan, tetapi tidak berhasil. Dan Tsar Vasily menghadapi ancaman baru. Penipu baru muncul - False Dmitry II, yang telah berhasil merebut tanah Severshchina, Bryansk, dan Verkhovskaya. Bolotnikov ditawari negosiasi tentang persyaratan penyerahan kota. Shuisky berjanji untuk menjaga kebebasan bagi para pemimpin dan peserta pemberontakan. Kesepakatan yang dicapai dimeteraikan dengan sumpah khusyuk, dan pada 10 Oktober 1607, Tula membuka gerbangnya untuk tentara tsar.
Tsar Vasily menipu para pemimpin pemberontakan. Shuisky buru-buru mengumumkan bahwa pengampunan hanya berlaku untuk "tahanan Tula" biasa, dan bukan untuk para pemimpin pemberontakan. Tulyaks benar-benar diampuni, para bangsawan pemberontak turun dengan orang buangan. Shakhovsky diangkat menjadi biarawan. "Tsarevich Peter" digantung. Bolotnikov dikirim ke Kargopol dan diam-diam tenggelam. Banyak pemberontak biasa dikirim ke kota-kota, dan mereka yang berakhir di Moskow, tanpa suara dan debu, dicekik.
Dengan demikian, pemerintah Moskow memadamkan perang petani dengan memobilisasi hampir semua cadangan dan menanggapi teror dengan teror. Namun, Shuisky, setelah membubarkan sebagian besar tentara dan berpikir bahwa kekacauan akan segera berakhir, salah perhitungan. Semuanya baru saja dimulai. Dmitry Palsu kedua muncul, yang diikuti oleh sisa-sisa Bolotnikovit. Polandia menjadi aktif kembali.
